기원 정사의 종소리, 제행무상의 울림이다. 사라 쌍수의 꽃의 빛깔, 성자 필향의 이치를 나타낸다.》 헤이안 말기. 헤이안 가문은 권력, 무력, 재력 모든 면에서 화려하게 누리고 있었다. 망자가 보이는 눈을 가진 남자 · 타이라노 시게모리는 미래가 보이는 눈을 가진 비파법사의 소녀 · 비와를 만나면서 「너희는 곧 멸망할 것」 이라고 예언한다. 귀족 사회에서 무가 사회로―― 일본이 역사적 전환을 이루는 격동의 15년의 막이 열린다.
그 날 카라쿠라 마을에는 처음으로 이변이 일어났다. 정체를 알 수 없는 생물체 '블랑크' 무리가 마을을 떠돌기 시작한 것이다. 이변에 대해 조사를 시작한 사신대행 쿠로사키 이치고와 쿠치키 루키아. 그런 그들 앞에 참백도 미륵환을 든 수수께끼의 소녀 센나가 나타난다. 소속부대를 비롯해 자신에 대해서는 어떠한 이야기도 하려하지 않는 센나의 정체는 베일에 가려진 채였다.