일족으로부터 탈출해 미국 시골로 숨어든 전직 닌자 조 히간은 암살자들의 기습을 받는다. 조의 가족들도 배신에 대한 대가로 살해달한다. 살아남은 조는 가족과 친구들의 복수를 위해 닌자 카무이로 돌아가 자신을 만든 일족을 무너무너트리기로 결심한다.
도쿄에 사는 소년 '타키'와 시골에 사는 소녀 '미츠하'는 서로의 몸이 뒤바뀌는 신기한 꿈을 꾼다. 낯선 가족, 낯선 친구들, 낯선 풍경들. . 반복되는 꿈과 흘러가는 시간 속, 마침내 깨닫는다
