일본 남쪽에 위치한 섬 남십자(南十字)도. 어느 날 밤, 섬의 해변에 츠나시 타쿠토라는 이름의 소년이 섬에 헤엄쳐 찾아온다. 일본 본토에서부터 헤엄쳐 온 이상한 소년 타쿠토는 섬의 학교 남십자 학원 고등부에 입학하여 타고난 밝고 적극적인 성격으로 학원의 학생들과의 교류를 맺어간다....
자신이 마녀라는 것 외 모든 기억을 잊어버린 여자 ‘베요네타’. 자신을 공격해 오는 천사들을 사냥하며 하루하루를 지내던 ‘베요네타’는 라그나교의 우두머리 ‘발더’를 보자 잊었던 기억의 일부가 떠오른다. 이에 ‘발더’에게 흥미를 느낀 ‘베요네타’는 그를 만나기 위해 종교 도시 비그리드로 떠나게 된다. 종교도시 비그리드로 향하던 ‘베요네타’ 앞에는 우연처럼 그녀의 기억을 상기시키는 만남들이 계속 되는데… ‘베요네타’의 과거를 이야기하는 베일에 쌓인 여자 ‘잔느’ 저널리스트인 자신의 아버지를 죽인 원수라며 ‘베요네타’를 계속해서 쫓아 다니는 남자 ‘루카’ 그리고 ‘베요네타’를 엄마라고 부르며 그리워하는 어린 소녀 ‘세레사’
모두가 천하통일의 뜻을 펼치는 전국시대! 천하를 차지하기 위한 싸움 때문에 천하의 지형은 급격하게 바뀌고 있다. 오다 노부나가 역시 전국 재패의 뜻을 이루기 위해 세력을 모아 일어난다. 엄청난 속도로 세력을 넓혀가고 있는 오다 노부나가. 이런 노부나가를 저지하기 위해 다타 마사무네와 그의 라이벌이 될 사나다 유키무라가 나타난다. 천하통일의 꿈을 위해 싸움을 이어나가는 남자들의 이야기가 펼쳐진다!
1번의 머리띠를 가진 자가 모든 것을 지배하는 어둠의 검객도. 그 곳에 있는 유일한 규정은 단 하나. 오직 2번만이 1번과 싸울 수 있다는 것. 어린 시절 눈 앞에서 아버지를 잃은 소년은 아버지의 원수인 저스티스라는 건맨에게 복수 할 것을 맹세한다. 이후 세월이 흐르고 2번의 머리띠를 두르게 된 소년은 더 이상 약한 어린아이가 아닌 아프로 사무라이가 되어있었다. 1번을 죽일 권리를 얻은 소년은 과연 저스티스를 찾아서 아버지의 복수를 이룰 수 있을 것인가?
먼 미래, 마지막 전쟁 이후 마침내 뱀파이어들이 밤을 지배하게 된다. 그러나 그들은 알 수 없는 원인으로 점차 소멸해가고, 일부 남은 뱀파이어들만이 사람들을 공포에 떨게 한다. 사람들의 피해가 늘어감과 동시에 이러한 뱀파이어들을 잡기 위한 뱀파이어 헌터들이 탄생한다. 이 가운데 뱀파이어와 인간의 혼혈인 D는 뛰어난 사냥 솜씨와 출중한 외모, 그리고 알 수 없는 신비감으로 인해 사람들 입에 회자된다....