대기업 아마기 코퍼레이션에서 운영하는 투기장. 그 곳에서 만들어진 생명체 플레이어(ZETMAN)은 본래 아마기 그룹을 위해 아무 의지 없이 싸우던 생명체였으나, 어느 순간 갑자기 지성을 가지게 된 개체가 나오면서 13명의 플레이어가 반역을 일으키고는 탈주하여 인간사회로 숨어든다. 아마기 그룹은 이런 플레이어들을 회수하기 위해 ZET라는 새로운 사냥용 플레이어를 만들지만, 어느 한 연구원에 의해 ZET는 사라지고 만다...
가나가와현의 쇼난, 에노시마에 이사온 남자 고교생 사나다 유키는 다른사람들과 커뮤니케이션에 익숙치 않아, 지금까지 친구라 불렸던 존재가 없었다. 그러던 어느 날, 우주인이라 자칭하는 소년 하루에게 이끌려 낚시를 권유받게 되어...
1만2천 년 후, 지구를 지키기 위한 아쿠에리아 병기의 이야기
