여름대회에서 고시엔을 앞둔 결승전에서의 통한의 패배를 겪은 세이도 고등학교 야구부. 그 동안 든든하게 지켜줬던 3학년생들의 졸업과 신 캡틴 미유키 카즈야를 중심으로 한 신팀의 개시가 이뤄지기 시작한다. 여름방학이 끝나고 단풍이 물드는 계절과 함께 열리는 가을대회가 세이도에 찾아온다. 가을대회의 우승팀은 3월에 있을 봄 고시엔에 참가가 가능하기에 카타오카 감독님을 붙잡기 위해서라도 그리고 여름의 치욕을 갚기 위해서라도 세이도 야구부는 가을대회의 우승을 노리며 힘차게 달려나간다. 그러나 첫 경기의 상대는 동도쿄의 여름 고시엔 출전 팀인 테이토 고등학교, 과연 세이도 야구부는 가을의 승리를 따낼 수 있을 것인가?
물을 접하고 특별한 애착을 가지게 되는 나나세 하루카는 중학교에 진학하여 새로운 경험을 하게 된다. 수영부에 입부하여 마코토와 시이나 아사히, 키리시마 이쿠야와 넷이서 혼계영 팀을 짜서 시합에 도전한다. 목표와 사고방식이 모두 다른 네사람은 저마다의 고민을 안고 있고 혼계영 연습도 순탄하지 않은데..... 어려움을 헤치고 진정한 한 팀이 될 수 있을까?
