성력 0044년 엔터테인먼트가 완전히 금지된 랑카스타에 AKB0048은 라이브를 개시한다. 이 공연 덕분에 예능에 대한 금지가 조금이나마 해제되기 시작하는 성력 0048년, 4년 전 라이브를 생생하게 기억하는 소녀 세명이 AKB0048 제77기 연구생 오디션 1차 심사에 합격한다. 새로운 스타가 되기 위해 선택된 제77기 연구생을 중심으로 한 이야기가 지금 막 시작되려 하고 있다.
그 날 카라쿠라 마을에는 처음으로 이변이 일어났다. 정체를 알 수 없는 생물체 '블랑크' 무리가 마을을 떠돌기 시작한 것이다. 이변에 대해 조사를 시작한 사신대행 쿠로사키 이치고와 쿠치키 루키아. 그런 그들 앞에 참백도 미륵환을 든 수수께끼의 소녀 센나가 나타난다. 소속부대를 비롯해 자신에 대해서는 어떠한 이야기도 하려하지 않는 센나의 정체는 베일에 가려진 채였다.
