어린 나이부터 초자연적인 능력으로 안전한 과학시설에 갇힌 기리하라 형제가 오작동을 막고 있던 장벽을 뚫고 탈출한 내용이다. 이 이야기는 또한 키리하라 형제를 쫓기 위해 노력하는 쿠로키 형제를 따라다닌다.

지구 멸망의 위기에서 발동한 네크로시스 작전의 발안자였던 애드록 서스턴은 작전을 반대하여 구금되어 있다가 탈출, 인간형 코랄리언 유레카와 함께 인류를 구하기 위해 나선다. 작전의 오류를 스스로의 희생으로 막은 애드록 덕분에 인류는 멸망의 위기를 가까스로 넘기지만... 한편, 아버지를 잃은 랜턴은 국경도시 벨 포레스트에서 단조로운 나날을 보내고 있었다. 그러던 어느날, 랜턴 앞에 LFO라는 세계에서 가장 오래된 기체 니르밧슈가 내려오고 그 조종석에서 유레카라고 지칭하는 소녀가 모습을 드러낸다.

가마쿠라 시대의 일본. '미나모토노 요시츠네'는 형인 '미나모토노 요리토모로'부터 도망쳐 산 속의 외딴 집으로 숨어들어간다. 이 집의 주인은 '쿠로미츠'라는 한 아름다운 여인. 언제부터인지 '요시츠네'와 '쿠로미츠'는 남녀의 관계를 맺는다. 그러나 쿠로미츠에겐 무서운 비밀이 숨겨져있었으니, 그것은 바로 그녀가 불로불사의 흡혈귀였다는 것!...

죽음을 각오한 후코 앞에 나타난 불사의 몸을 지닌 의문의 남자 '언데드' 앤디는 만진 자에게 불운을 가져오는 후코의 힘으로 죽기 위해 후코와 함께 다니기로 한다.  그런데 어느 조직에서 온 추적자가 두 사람에게 접근하는데―!?

서기 2029년, 기업 네트워크가 지구를 뒤덮고 전자와 빛이 빠르게 오가지만 국가와 민족의 개념은 아직 남아 있는 정보화되지 않은 근미래 일본.

전신의체 사이보그, 쿠사나기 모토코는 정예 부대를 이끌며 범죄를 사전에 방지할 특수부대 설립을 구상한다.

같은 생각을 하던 내무성의 아라마키 다이스케는 쿠사나기 팀을 스카우트해 공성 조직 공안 9과, '공각기동대'로 활동을 시작한다.

국가 간의 음모가 소용돌이치는 전뇌 범죄에 맞서 싸우던 중 한 사건의 수사 과정에서 정체불명의 해커 '인형사'의 존재가 드러난다.

쿠사나기를 기다리는 운명, 그리고 인형사의 목적은 무엇인가.

새로운 시대의 사이버펑크 액션이 시작된다!

토모키를 오랫동안 짝사랑하던 히요리는 큰 마음을 먹고 자신의 마음을 토모키에게 고백한다. 그러나 그의 대답을 들으러 가는 길에 히요리는 사고로 죽게 된다. 히요리는 토모키가 보고 싶은 마음에 자발적으로 엔젤로이드가 돼, 제타라는 이름으로 다시 지상에 내려온다. 하지만 제타는 이미 적에게 세뇌 당한 엔젤로이드. 그녀는 토모키를 죽이라는 마스터의 명령을 받아 자신이 살던 마을을 파괴한다. 다른 엔젤로이드들이 히요리를 적으로부터 구해내려고 노력하지만, 그럴수록 제타의 폭주는 그칠 줄 모르는데…. 과연 엔젤로이드들은 무사히 히요리를 구할 수 있을까?

제4회 레드라인 첫 참가 이후 현재까지 레드라인 4연승이라는 대기록을 달성한 레이서. 종족은 해양족이다. 이 세계관 내에서는 그 명성이 상당하여 레드라인의 절대왕자(王者), The king of kings, Mr. 레드라인 등의 다양한 이명을 보유하고 있으며 레드라인 대회에서 유일하게 시드권을 가진 레이서이기도 하다. 철인이라는 이름대로 먼치킨으로 몸이 무려 기계로 이루어져 있고 등에 플러그 비슷한 접속부가 달려 있어서 머신과 융합, 머신 일체형 레이스를 하고 있으며 머신뿐만 아니라 자기 자신의 몸도 함께 개조와 업그레이드를 쉬지 않는다. 이 때문에 다른 레이서들의 관념이 '나와 차'라면 자신의 경우는 나는 차라는 것을 모토로 삼고 있기도 하다. 어느 칼과 그 소유주가 비슷한 존재론을 갖고 있다