돌풍을 몰고 온 스즈메가하라 중학교의 전학생 츠무지카제 코요리! 전학 첫날부터 탁구부에 들어가 부원들을 모두 이겨버리는데... 꿈을 향해 청춘을 보내는 탁구 소녀들의 이야기가 시작된다!
이 지구는 우리가 사는 지구와는 조금 다른 세계. 이곳은 이성에 의해 돌아가는 푸른 세계이다. 하지만 다른 세계로부터 나이트플라이 오노트라고 하는 침략자가 나타나 지구를 침공한다. 이에 맞서기 위해 인류는 스칼렛 라이더를 결성했지만 모두 패배하고 만다. 그래서 새로운 소년 5명을 모아 스칼렛 라이더 젝스를 결성하고 17세 연구진 아사기 아키라가 지휘관으로 부임한다. 하지만 아키라가 부임하자마자 나이트플라이 오느트의 침공이 시작되는데... 아키라와 소년들의 청춘과 성장 이야기가 시작된다!
2030년대, 탐정인 아케치 코고로를 중심으로 모인 소년 탐정단이 그들의 특별한 능력으로 사건들을 해결해나가고 있었다. 어느날, 탐정단의 일원인 하나사키 켄스케는 의문의 소년인 코바야시 요시오와 만나게 된다. 코바야시는 '수수께끼의 안개'에 의해 죽지 않는 몸이 되어 버려 다른 사람과의 만남을 꺼려하고 있는 소년이다. 하나사키는 그런 그에게 관심을 보이며 소년탐정단에 들어올 것을 권유한다. 그 둘의 만남은 세기의 범죄자인 괴인 20면상과 얽히게 되고 또 아케치 코고로와도 인연을 맺게 되는데......
