이 이야기는 우등생으로 꿈에 그리던 아카데미에 등록한 소년 유우키 카가미를 중심으로 전개되며, 소년이 금지 된 여학생 기숙사에 실수로 들어간다. 학교를 떠나야 할 가능성에 직면 한 유우키는 기숙사에서 소녀로 옷을 입어야한다. 무엇보다도 그는 그를 돌봐야하는 여교사 카키 노자 카 아야나와 함께 방을 잡는다.
누군가를 생각하는 일상은 때론 달콤하고 때론 아프다. 그런, 될 대로 밖에 되지 않는 나날도, 반드시, 언젠가. 옛 애인의 결혼식, 남자학교 선생님과 학생, 몸과 마음의 변화를 맞는 사춘기 소꿉친구. 어떤 형태로든 그 누구도 사랑하는 것과 살아가는 방법에는 동등한 가치가 있다. 그리고 어설프게 누군가를 그리워하던 날들은 분명 언젠가 사랑스러운 추억이 될 거야. 그런
3년 전 두 사람은 오키나와의 외딴섬 해변에서 만났다. 소설가 지망생 하시모토 슌은 울적하게 생활하는 고등학생 치바나 미오에게 끌려 작업을 걸다시피 말을 건다. 둘은 나날이 거리를 좁혀가지만 미오는 섬을 떠나게 된다. 그리고 3년 후 섬에 돌아온 미오는 “3년을 생각했어. 남자라도 슌이 좋아”라며 슌에게 다가간다. 하지만 슌은 정작 미오와 연인이 되자고 선뜻 나서지 못하는데—.
카스가 아리타가 알고 있던 일상은 '붕괴현상'이라 불리는 불가사의한 사건으로 인해 사촌 여동생 히지리와 함께 이공간으로 사라져버린다. 붕괴현상을 밝히고 히지리를 되찾기 위해 왕립 비브리아 학원에 입학한 아라타. 그곳에서 기다리고 있던 것은 7명의 미소녀 마도사였는데. . . 러브 코미디 이면서도 가끔 진지한 마법학원 이야기가 시작 된다.
