일본의 어딘가에 존재하는 세상에서도 굴지의 명문 여고인 성 미아토르 여학원, 성 스피카 여학원, 성 르 림 여학원에 다니게 되어버린 3명의 소녀인 나기사, 히카리, 키즈나. 게다가 3명 모두 집을 떠나고, 3학원 합동 기숙사인
크로우국에 살고 있는 샤오랑과 사쿠라. 신분의 차이를 넘어 마음을 나누던 두 사람이었지만, 갑자기 나타난 자객에 의해 이변이 일어난 사쿠라는 모든 기억을 잃고 만다. 사쿠라를 구할 방법은 단 하나. 다른 세계로 흩어진 기억의 깃털을 모으는 것.
불면증에 시달리는 나카미는 문화제를 준비하다가 천체관측실에서 그와 같이 불면증에 시달리는 마가리와 만난다. 둘은 서로 같은 고민을 안고 있는 것과 동시에 옆에 있을 때에는 잠을 잘 수 있다는 것을 알게된다. 둘은 천체관측실을 둘만의 비밀기지로 삼아 몰래 천체관측실에서 함께 자기도 하고 휴식을 취하기도 한다. 하지만 얼마 가지 못해 천체관측실의 무단 사용이 학교 측에 알려지게 되고 쫒겨날 위기에 처하게 된다. 그 때 나카미의 빠른 머리회전으로 천문부를 부활시켜서 쫒겨나는 것을 막고 둘만의 부 활동을 시작한다. 그들은 활동을 함께하면서 서로에게 점점 희미한 사랑을 더해 간다.
