스텔라 여학원의 서바이벌부(C3부)의 이야기! 야마토 유라는 소심한 성격을 고쳐보려고 스텔라 여학원에 들어간다! 유라는 그곳에서 밀리터리 덕후 룸메이트 카시마 소노라를 만난다. 방 곳곳에 있는 밀리터리 용품들과 전쟁영화를 보고 밀리터리에 푹 빠져버린 유라! 유라는 소노라의 제안에 빠져 C3부에 들어가게 되는데... C3부에서의 활기차고 흥미진진한 이야기가 펼쳐진다!
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그 날 카라쿠라 마을에는 처음으로 이변이 일어났다. 정체를 알 수 없는 생물체 '블랑크' 무리가 마을을 떠돌기 시작한 것이다. 이변에 대해 조사를 시작한 사신대행 쿠로사키 이치고와 쿠치키 루키아. 그런 그들 앞에 참백도 미륵환을 든 수수께끼의 소녀 센나가 나타난다. 소속부대를 비롯해 자신에 대해서는 어떠한 이야기도 하려하지 않는 센나의 정체는 베일에 가려진 채였다.
