작품의 배경은 타이쇼우 시대(다이쇼우 시대에 약간 변화를 준 가상의 시대) 태정4년. 강마전쟁이 발발 3년간의 치열한 전투후 악의 세력은 잠시 그 모습을 감춘다. 이 전투의 영웅인 요네다 중장은 전쟁으로부터 1년뒤, 어둠의 세력이 다시 부활하려함을 느끼고 광무라는 병기를 이용한 동경수비대-제국화격단을 결성한다.....
그 날 카라쿠라 마을에는 처음으로 이변이 일어났다. 정체를 알 수 없는 생물체 '블랑크' 무리가 마을을 떠돌기 시작한 것이다. 이변에 대해 조사를 시작한 사신대행 쿠로사키 이치고와 쿠치키 루키아. 그런 그들 앞에 참백도 미륵환을 든 수수께끼의 소녀 센나가 나타난다. 소속부대를 비롯해 자신에 대해서는 어떠한 이야기도 하려하지 않는 센나의 정체는 베일에 가려진 채였다.
도쿄에 사는 소년 '타키'와 시골에 사는 소녀 '미츠하'는 서로의 몸이 뒤바뀌는 신기한 꿈을 꾼다. 낯선 가족, 낯선 친구들, 낯선 풍경들. . 반복되는 꿈과 흘러가는 시간 속, 마침내 깨닫는다
