배경은 1940년대의 지구와 비슷한 다른 세계를 무대로 하고 있으며, 세계를 구하기 위해 이형(異形)의 적 '네우로이'와 싸우는 소녀들의 이야기를 그리고 있다. 작품에서는 눈길을 사로잡는 항공 액션은 물론, 세계 각국에서 모여든 우수한 파일럿 소녀들이 전투를 통해서 우정을 돈독히 하고 조금씩 성장해 나가는 모습도 함께 보여질 예정이다.(참고로 <제로의 사역마>의 작가인 야마구치 노보루가 소설판의 집필을 담당하여 현재 2권까지 발매되어 있는 상태인데, 애니메이션이 대전 후기의 서부전선을 배경으로 하고 있는데 반해 소설에서는 대전 초기의 북구 스옴스 공방전을 무대로 하고 있어 내용상으로는 크게 관련이 없다고 말할 수 있다) 

A부터 F까지 성적순으로 반을 편성하는 명문 '사립 하쿠센관 학원 고교'에는 최상위 7명의 학생들을 별도로 관리하는 S·A(스페셜 A)반이 존재한다. S·A반에 소속된 아이들은 엘리트인 동시에 엄청나게 부유한 집안의 아이들로서 전교생들의 선망의 대상이 되고 있다.  이 안에서 하나조노 히카리는 평범한 목수의 딸로 다른 아이들과 달리 평범한 서민층에 속하지만 성적은 꾸준히 2등을 유지한다. 하지만 히카리는 어릴 적 굴욕을 안겨준 하쿠센관 학원 고교의 1등이자 슈퍼 엘리트인 타키시마 케이를 실력으로 꺾고자 매일 정진중이지만, 좀처럼 만년 2등의 위치를 벗어나기 힘들다. 서로가 앙숙인 히카리와 타키시마... 그리고 아키라, 타다시, 메구미, 준, 류 등 S·A의 개성넘치는 멤버들에게 매일같이 일어나는 대소동.

그 옛날- 한 마리 대영호(大靈狐)가 미즈치 가의 수호신으로 떠받들어졌다. 이름을 쿠우겐이라고 하며 갖은 술법을 자유자재로 부리는 몹시 현명한 여우였다. 그러나 동시에 소동을 아주 좋아했다. 장난이라 하기에는 너무 악랄한 소행을 반복하는 쿠우겐을 보다 못한 미즈치의 사제는 일곱 낮 일곱 밤동안 싸워 쿠우겐을 뒷산의 사당에 봉인했다.  그리고 현재- 미지의 요괴의 표적이 된 미즈치 가의 후예 타카가미 토오루를 지키기 위해 드디어 쿠우겐이 사당에서 풀려나왔다! 그러나 그 태도는 사람들에게 두려움을 품게 하던 전설과는 반대인 경박 그 자체. 토오루에게는 '쿠우'라는 귀여운 별명으로 불릴 정도인데...  깊은 봉인에서 깨어난 여우신령의 좌충우돌 우리 집 수호 대작전!

일본은 미디어 양화위원회에 의해 ‘미디어 양화법’이 실행되고 각종 미디어와 매체들이 엄격한 검열의 대상이 된다. 심지어 양화특무기관은 법이라는 이름으로 이에 저항하는 사람에게 무력까지 행사한다. 검열에 대항하기 위해 ‘도서관 자유법’을 만들고, 도서관의 책을 방위하는 조직 ‘도서대’가 생겨났다. 시간이 흘러 두 집단의 갈등이 더 큰 불길로 번지는데....... 

총성과 갱들의 싸움이 끊이질 않는 무법지대에서 조금 벗어난, 한 교회 목사(천주교 신부) 집에 살고 있는 소녀, '하나 모레노스'. 목사 부부는 고아가 된 하나를 양녀로 받아들이지만 그 집의 하녀나 마찬가지. 모든 허드렛일을 도맡아 하고, 부부의 딸과 아들한테는 소, 돼지만도 못한 대접을 받는다. 그러나, 부부가 하나를 데리고 사는 이유는 하녀 대신으로 쓰기 위해서이고, 또 한 가지는 매달 들어오는 양육비를 가로채기 위해서다.

범접할 수 없는 절대미모, 세계 콩쿠르에서 톱을 석권한 재능지존, 기품 있는 수려한 자태!! 그녀는 머리에서부터 발끝까지 백점 만점에 백점이다!!  완전무결한 그녀, 노기자카 하루카에게 아무도 모르는 비밀이 한 가지가 있으니…. 애니메이션에 열광하고 게임에 목을 매는 아키바계(흔히 오타쿠라고 하는)!!! 우연히 같은 반 아야세 유우토에게 들켜버리고 만다!! 하지만 오히려 비밀을 알게 되면서 둘은 급격히 가까워 지는데…?!

두 사람의 만남이 세상을 바꾼다!  어릴 적 가족을 잃고 해결사 일을 하고 있는 고교생 쿠레나이 신쿠로에게 어떤 소녀를 지켜 달라는 의뢰가 들어왔다. 소녀의 이름은 쿠호인 무라사키. 세계 굴지의 대재벌의 외동딸.  자세한 사정도 듣지 못한 채 신쿠로는 무라사키와의 공동 생활을 시작하고…. 그녀의 제멋대로인 성격에 휘둘리면서도, 그 시끄러운 일상에 신쿠로가 익숙해지기 시작할 무렵, 최악의 사자가 그들을 찾아와 종말을 고한다.  숙명, 낙원, 그리고 무라사키의 소원. 모든 것을 알게 된 신쿠로의 선택은….