1910년대. 육군 직속・세이호 중학교에 다니고 있는 이와모토 코도는군의 지시에 따라 전국 각지의 초자연현상을 조사하고 있었다.“검은 눈"이 내린다는 소문이 있는 마을에서 만난,특별한 힘을 가진 소년….능력을 병이라고 생각하는 소년에게 사용법을 알려준 이와모토는자신과의 공통점을 이야기하며 그에게 학원의 추천서를 건넨다──.찾아간 임무처에서는, 여러 괴이들이 이와모토를 기다리고 있다.그들의 시대를 풀어내는, 낭만기담 개막!
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그 날 카라쿠라 마을에는 처음으로 이변이 일어났다. 정체를 알 수 없는 생물체 '블랑크' 무리가 마을을 떠돌기 시작한 것이다. 이변에 대해 조사를 시작한 사신대행 쿠로사키 이치고와 쿠치키 루키아. 그런 그들 앞에 참백도 미륵환을 든 수수께끼의 소녀 센나가 나타난다. 소속부대를 비롯해 자신에 대해서는 어떠한 이야기도 하려하지 않는 센나의 정체는 베일에 가려진 채였다.
